Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPN18Q99952 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPN18Q99952 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPN18Q99952 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPN18Q99952 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPN18Q99952 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPN18Q99952 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPN18Q99952 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPN18Q99952 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPN18Q99952 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN18Q99952 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN18Q99952 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN18Q99952 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPN18Q99952 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPN18Q99952 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPN18Q99952 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPN18Q99952 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPN18Q99952 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPN18Q99952 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPN18Q99952 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPN18Q99952 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPN18Q99952 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPN18Q99952 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPN18Q99952 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPN18Q99952 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPN18Q99952 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPN18Q99952 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPN18Q99952 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPN18Q99952 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPN18Q99952 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPN18Q99952 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPN18Q99952 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN18Q99952 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN18Q99952 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN18Q99952 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPN18Q99952 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPN18Q99952 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPN18Q99952 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPN18Q99952 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPN18Q99952 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPN18Q99952 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPN18Q99952 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPN18Q99952 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPN18Q99952 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPN18Q99952 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPN18Q99952 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN18Q99952 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN18Q99952 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN18Q99952 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPN18Q99952 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPN18Q99952 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPN18Q99952 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPN18Q99952 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPN18Q99952 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms