Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRRX2Q99811 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRRX2Q99811 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRRX2Q99811 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRRX2Q99811 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRRX2Q99811 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRRX2Q99811 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRRX2Q99811 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRRX2Q99811 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRRX2Q99811 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRRX2Q99811 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRRX2Q99811 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRRX2Q99811 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms