Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM9SF2Q99805 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TM9SF2Q99805 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM9SF2Q99805 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TM9SF2Q99805 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms