Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPS8Q99627 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPS8Q99627 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPS8Q99627 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPS8Q99627 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPS8Q99627 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPS8Q99627 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPS8Q99627 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COPS8Q99627 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPS8Q99627 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPS8Q99627 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPS8Q99627 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPS8Q99627 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPS8Q99627 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COPS8Q99627 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPS8Q99627 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPS8Q99627 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COPS8Q99627 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167 ms