Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
IFT140Q96RY7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
IFT140Q96RY7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
IFT140Q96RY7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
IFT140Q96RY7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
IFT140Q96RY7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
IFT140Q96RY7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
IFT140Q96RY7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
IFT140Q96RY7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
IFT140Q96RY7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
IFT140Q96RY7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
IFT140Q96RY7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
IFT140Q96RY7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
IFT140Q96RY7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
IFT140Q96RY7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
IFT140Q96RY7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
IFT140Q96RY7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
IFT140Q96RY7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
IFT140Q96RY7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
IFT140Q96RY7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
IFT140Q96RY7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
IFT140Q96RY7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
IFT140Q96RY7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
IFT140Q96RY7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
IFT140Q96RY7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
IFT140Q96RY7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
IFT140Q96RY7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC43.82■■■■■ 4.61
IFT140Q96RY7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
IFT140Q96RY7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
IFT140Q96RY7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
IFT140Q96RY7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
IFT140Q96RY7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
IFT140Q96RY7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
IFT140Q96RY7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
IFT140Q96RY7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC43.72■■■■■ 4.59
IFT140Q96RY7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
IFT140Q96RY7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
IFT140Q96RY7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
IFT140Q96RY7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
IFT140Q96RY7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
IFT140Q96RY7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
IFT140Q96RY7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
IFT140Q96RY7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC43.64■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
IFT140Q96RY7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.61■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC43.61■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
IFT140Q96RY7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
IFT140Q96RY7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
IFT140Q96RY7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC43.57■■■■■ 4.56
IFT140Q96RY7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms