Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGD4Q96M96 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD4Q96M96 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGD4Q96M96 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FGD4Q96M96 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FGD4Q96M96 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms