Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOLD1Q96LR9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOLD1Q96LR9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOLD1Q96LR9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
APOLD1Q96LR9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOLD1Q96LR9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOLD1Q96LR9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOLD1Q96LR9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOLD1Q96LR9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOLD1Q96LR9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOLD1Q96LR9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOLD1Q96LR9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOLD1Q96LR9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOLD1Q96LR9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOLD1Q96LR9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOLD1Q96LR9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOLD1Q96LR9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOLD1Q96LR9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOLD1Q96LR9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOLD1Q96LR9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOLD1Q96LR9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOLD1Q96LR9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOLD1Q96LR9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOLD1Q96LR9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APOLD1Q96LR9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOLD1Q96LR9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOLD1Q96LR9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOLD1Q96LR9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOLD1Q96LR9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOLD1Q96LR9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.6 ms