Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ALPK3Q96L96 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALPK3Q96L96 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALPK3Q96L96 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALPK3Q96L96 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms