Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PGBD1Q96JS3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PGBD1Q96JS3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PGBD1Q96JS3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PGBD1Q96JS3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PGBD1Q96JS3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PGBD1Q96JS3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PGBD1Q96JS3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PGBD1Q96JS3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PGBD1Q96JS3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PGBD1Q96JS3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PGBD1Q96JS3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PGBD1Q96JS3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PGBD1Q96JS3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PGBD1Q96JS3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PGBD1Q96JS3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PGBD1Q96JS3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PGBD1Q96JS3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PGBD1Q96JS3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PGBD1Q96JS3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PGBD1Q96JS3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PGBD1Q96JS3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PGBD1Q96JS3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PGBD1Q96JS3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PGBD1Q96JS3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PGBD1Q96JS3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PGBD1Q96JS3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PGBD1Q96JS3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PGBD1Q96JS3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PGBD1Q96JS3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PGBD1Q96JS3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PGBD1Q96JS3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PGBD1Q96JS3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PGBD1Q96JS3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PGBD1Q96JS3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PGBD1Q96JS3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PGBD1Q96JS3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PGBD1Q96JS3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PGBD1Q96JS3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PGBD1Q96JS3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PGBD1Q96JS3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms