Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSL1Q96IY1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSL1Q96IY1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSL1Q96IY1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSL1Q96IY1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSL1Q96IY1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSL1Q96IY1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms