Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED8Q96G25 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED8Q96G25 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED8Q96G25 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED8Q96G25 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED8Q96G25 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED8Q96G25 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED8Q96G25 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED8Q96G25 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED8Q96G25 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED8Q96G25 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED8Q96G25 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED8Q96G25 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED8Q96G25 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED8Q96G25 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED8Q96G25 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED8Q96G25 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED8Q96G25 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED8Q96G25 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED8Q96G25 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED8Q96G25 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED8Q96G25 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED8Q96G25 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED8Q96G25 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED8Q96G25 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED8Q96G25 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED8Q96G25 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED8Q96G25 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms