Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMIM12Q96EX1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM12Q96EX1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM12Q96EX1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM12Q96EX1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms