Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MALSU1Q96EH3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MALSU1Q96EH3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MALSU1Q96EH3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MALSU1Q96EH3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MALSU1Q96EH3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MALSU1Q96EH3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MALSU1Q96EH3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MALSU1Q96EH3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MALSU1Q96EH3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MALSU1Q96EH3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MALSU1Q96EH3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MALSU1Q96EH3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MALSU1Q96EH3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MALSU1Q96EH3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MALSU1Q96EH3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MALSU1Q96EH3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms