Protein–RNA interactions for Protein: Q96EC8

YIPF6, Protein YIPF6, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF6Q96EC8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YIPF6Q96EC8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF6Q96EC8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
YIPF6Q96EC8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF6Q96EC8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms