Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL29Q96CT2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL29Q96CT2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL29Q96CT2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms