Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms