Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TIFAQ96CG3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TIFAQ96CG3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TIFAQ96CG3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TIFAQ96CG3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms