Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RUNDC1Q96C34 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RUNDC1Q96C34 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RUNDC1Q96C34 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RUNDC1Q96C34 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RUNDC1Q96C34 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RUNDC1Q96C34 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RUNDC1Q96C34 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RUNDC1Q96C34 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
RUNDC1Q96C34 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
RUNDC1Q96C34 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RUNDC1Q96C34 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RUNDC1Q96C34 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RUNDC1Q96C34 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RUNDC1Q96C34 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RUNDC1Q96C34 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RUNDC1Q96C34 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RUNDC1Q96C34 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RUNDC1Q96C34 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RUNDC1Q96C34 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RUNDC1Q96C34 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RUNDC1Q96C34 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RUNDC1Q96C34 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.77■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RUNDC1Q96C34 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms