Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHD2Q96C19 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHD2Q96C19 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD2Q96C19 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD2Q96C19 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFHD2Q96C19 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFHD2Q96C19 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFHD2Q96C19 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFHD2Q96C19 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFHD2Q96C19 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFHD2Q96C19 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFHD2Q96C19 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFHD2Q96C19 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFHD2Q96C19 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFHD2Q96C19 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHD2Q96C19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms