Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPTQ96BT3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPTQ96BT3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPTQ96BT3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPTQ96BT3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPTQ96BT3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms