Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC127Q96BQ5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC127Q96BQ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC127Q96BQ5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC127Q96BQ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC127Q96BQ5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC127Q96BQ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC127Q96BQ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC127Q96BQ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC127Q96BQ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC127Q96BQ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC127Q96BQ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC127Q96BQ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC127Q96BQ5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC127Q96BQ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC127Q96BQ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC127Q96BQ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC127Q96BQ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC127Q96BQ5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms