Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF34Q969K3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF34Q969K3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF34Q969K3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF34Q969K3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms