Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HLA-CQ95604 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HLA-CQ95604 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HLA-CQ95604 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-CQ95604 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-CQ95604 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-CQ95604 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-CQ95604 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-CQ95604 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-CQ95604 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HLA-CQ95604 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HLA-CQ95604 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-CQ95604 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-CQ95604 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-CQ95604 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-CQ95604 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HLA-CQ95604 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HLA-CQ95604 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms