Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP9XQ93008 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP9XQ93008 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP9XQ93008 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP9XQ93008 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms