Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMBR1Q8WVP7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMBR1Q8WVP7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMBR1Q8WVP7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBR1Q8WVP7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMBR1Q8WVP7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMBR1Q8WVP7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMBR1Q8WVP7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBR1Q8WVP7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMBR1Q8WVP7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMBR1Q8WVP7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMBR1Q8WVP7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMBR1Q8WVP7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMBR1Q8WVP7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMBR1Q8WVP7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LMBR1Q8WVP7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LMBR1Q8WVP7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMBR1Q8WVP7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMBR1Q8WVP7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBR1Q8WVP7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms