Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SKA2Q8WVK7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKA2Q8WVK7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKA2Q8WVK7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms