Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRUNE2Q8WUY3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRUNE2Q8WUY3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRUNE2Q8WUY3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRUNE2Q8WUY3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRUNE2Q8WUY3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRUNE2Q8WUY3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRUNE2Q8WUY3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRUNE2Q8WUY3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRUNE2Q8WUY3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRUNE2Q8WUY3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRUNE2Q8WUY3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRUNE2Q8WUY3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRUNE2Q8WUY3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PRUNE2Q8WUY3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRUNE2Q8WUY3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRUNE2Q8WUY3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRUNE2Q8WUY3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PRUNE2Q8WUY3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRUNE2Q8WUY3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRUNE2Q8WUY3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRUNE2Q8WUY3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRUNE2Q8WUY3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRUNE2Q8WUY3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PRUNE2Q8WUY3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRUNE2Q8WUY3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRUNE2Q8WUY3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRUNE2Q8WUY3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRUNE2Q8WUY3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRUNE2Q8WUY3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms