Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC12Q8WUD4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC12Q8WUD4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC12Q8WUD4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC12Q8WUD4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC12Q8WUD4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC12Q8WUD4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC12Q8WUD4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC12Q8WUD4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC12Q8WUD4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms