Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSC4DQ8WTU2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSC4DQ8WTU2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC4DQ8WTU2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSC4DQ8WTU2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms