Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC41

RNF217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF217Q8TC41 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF217Q8TC41 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF217Q8TC41 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF217Q8TC41 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF217Q8TC41 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF217Q8TC41 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF217Q8TC41 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF217Q8TC41 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF217Q8TC41 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF217Q8TC41 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF217Q8TC41 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF217Q8TC41 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF217Q8TC41 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF217Q8TC41 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF217Q8TC41 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF217Q8TC41 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF217Q8TC41 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF217Q8TC41 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms