Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSNK2A3Q8NEV1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK2A3Q8NEV1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK2A3Q8NEV1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSNK2A3Q8NEV1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms