Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNNM3Q8NE01 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNNM3Q8NE01 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNNM3Q8NE01 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CNNM3Q8NE01 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CNNM3Q8NE01 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNNM3Q8NE01 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM3Q8NE01 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM3Q8NE01 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM3Q8NE01 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM3Q8NE01 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNNM3Q8NE01 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNNM3Q8NE01 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNNM3Q8NE01 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNNM3Q8NE01 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNNM3Q8NE01 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNNM3Q8NE01 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNNM3Q8NE01 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNNM3Q8NE01 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms