Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC18Q8N456 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC18Q8N456 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC18Q8N456 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC18Q8N456 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC18Q8N456 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC18Q8N456 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC18Q8N456 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC18Q8N456 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC18Q8N456 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC18Q8N456 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC18Q8N456 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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