Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PROM2Q8N271 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PROM2Q8N271 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PROM2Q8N271 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PROM2Q8N271 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PROM2Q8N271 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PROM2Q8N271 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PROM2Q8N271 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PROM2Q8N271 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PROM2Q8N271 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PROM2Q8N271 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PROM2Q8N271 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PROM2Q8N271 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PROM2Q8N271 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PROM2Q8N271 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
PROM2Q8N271 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PROM2Q8N271 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PROM2Q8N271 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PROM2Q8N271 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
PROM2Q8N271 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms