Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC103Q8IW40 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC103Q8IW40 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC103Q8IW40 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms