Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PKD1L3Q7Z443 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PKD1L3Q7Z443 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PKD1L3Q7Z443 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PKD1L3Q7Z443 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PKD1L3Q7Z443 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PKD1L3Q7Z443 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PKD1L3Q7Z443 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PKD1L3Q7Z443 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PKD1L3Q7Z443 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PKD1L3Q7Z443 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PKD1L3Q7Z443 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PKD1L3Q7Z443 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PKD1L3Q7Z443 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PKD1L3Q7Z443 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PKD1L3Q7Z443 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PKD1L3Q7Z443 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD1L3Q7Z443 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PKD1L3Q7Z443 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PKD1L3Q7Z443 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms