Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LPCAT2Q7L5N7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPCAT2Q7L5N7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LPCAT2Q7L5N7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LPCAT2Q7L5N7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms