Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SV2BQ7L1I2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SV2BQ7L1I2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SV2BQ7L1I2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SV2BQ7L1I2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SV2BQ7L1I2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SV2BQ7L1I2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SV2BQ7L1I2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SV2BQ7L1I2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SV2BQ7L1I2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SV2BQ7L1I2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SV2BQ7L1I2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SV2BQ7L1I2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SV2BQ7L1I2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SV2BQ7L1I2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SV2BQ7L1I2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SV2BQ7L1I2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SV2BQ7L1I2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SV2BQ7L1I2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms