Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MED13LQ71F56 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MED13LQ71F56 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED13LQ71F56 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED13LQ71F56 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED13LQ71F56 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MED13LQ71F56 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED13LQ71F56 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED13LQ71F56 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED13LQ71F56 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED13LQ71F56 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED13LQ71F56 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED13LQ71F56 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED13LQ71F56 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED13LQ71F56 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED13LQ71F56 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED13LQ71F56 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MED13LQ71F56 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms