Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYNE3Q6ZMZ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYNE3Q6ZMZ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNE3Q6ZMZ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNE3Q6ZMZ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNE3Q6ZMZ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNE3Q6ZMZ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNE3Q6ZMZ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNE3Q6ZMZ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNE3Q6ZMZ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNE3Q6ZMZ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNE3Q6ZMZ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNE3Q6ZMZ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNE3Q6ZMZ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNE3Q6ZMZ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNE3Q6ZMZ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms