Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHBDF2Q6PJF5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHBDF2Q6PJF5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDF2Q6PJF5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHBDF2Q6PJF5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms