Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJE2

POMZP3, POM121 and ZP3 fusion protein, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMZP3Q6PJE2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POMZP3Q6PJE2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POMZP3Q6PJE2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POMZP3Q6PJE2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POMZP3Q6PJE2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POMZP3Q6PJE2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POMZP3Q6PJE2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POMZP3Q6PJE2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POMZP3Q6PJE2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POMZP3Q6PJE2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POMZP3Q6PJE2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POMZP3Q6PJE2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POMZP3Q6PJE2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POMZP3Q6PJE2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POMZP3Q6PJE2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POMZP3Q6PJE2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POMZP3Q6PJE2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POMZP3Q6PJE2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POMZP3Q6PJE2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POMZP3Q6PJE2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POMZP3Q6PJE2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POMZP3Q6PJE2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POMZP3Q6PJE2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POMZP3Q6PJE2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POMZP3Q6PJE2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POMZP3Q6PJE2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POMZP3Q6PJE2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POMZP3Q6PJE2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms