Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2D0

ZFP1, Zinc finger protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP1Q6P2D0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZFP1Q6P2D0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZFP1Q6P2D0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFP1Q6P2D0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFP1Q6P2D0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFP1Q6P2D0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFP1Q6P2D0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFP1Q6P2D0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFP1Q6P2D0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZFP1Q6P2D0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZFP1Q6P2D0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZFP1Q6P2D0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZFP1Q6P2D0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZFP1Q6P2D0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZFP1Q6P2D0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms