Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUS6

TCTN3, Tectonic-3, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN3Q6NUS6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN3Q6NUS6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCTN3Q6NUS6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCTN3Q6NUS6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN3Q6NUS6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN3Q6NUS6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN3Q6NUS6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCTN3Q6NUS6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTN3Q6NUS6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTN3Q6NUS6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTN3Q6NUS6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTN3Q6NUS6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTN3Q6NUS6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCTN3Q6NUS6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTN3Q6NUS6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTN3Q6NUS6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTN3Q6NUS6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms