Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICB4

FAM109B, Sesquipedalian-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM109BQ6ICB4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM109BQ6ICB4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM109BQ6ICB4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM109BQ6ICB4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM109BQ6ICB4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM109BQ6ICB4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM109BQ6ICB4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM109BQ6ICB4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM109BQ6ICB4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM109BQ6ICB4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM109BQ6ICB4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM109BQ6ICB4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms