Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CARMIL2Q6F5E8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CARMIL2Q6F5E8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
CARMIL2Q6F5E8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
CARMIL2Q6F5E8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CARMIL2Q6F5E8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CARMIL2Q6F5E8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CARMIL2Q6F5E8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CARMIL2Q6F5E8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CARMIL2Q6F5E8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CARMIL2Q6F5E8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CARMIL2Q6F5E8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CARMIL2Q6F5E8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CARMIL2Q6F5E8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
CARMIL2Q6F5E8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CARMIL2Q6F5E8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
CARMIL2Q6F5E8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.26
CARMIL2Q6F5E8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
CARMIL2Q6F5E8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
CARMIL2Q6F5E8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CARMIL2Q6F5E8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CARMIL2Q6F5E8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CARMIL2Q6F5E8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CARMIL2Q6F5E8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CARMIL2Q6F5E8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CARMIL2Q6F5E8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
CARMIL2Q6F5E8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CARMIL2Q6F5E8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CARMIL2Q6F5E8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
CARMIL2Q6F5E8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CARMIL2Q6F5E8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CARMIL2Q6F5E8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CARMIL2Q6F5E8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CARMIL2Q6F5E8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
CARMIL2Q6F5E8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
CARMIL2Q6F5E8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
CARMIL2Q6F5E8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CARMIL2Q6F5E8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
CARMIL2Q6F5E8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CARMIL2Q6F5E8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CARMIL2Q6F5E8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CARMIL2Q6F5E8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CARMIL2Q6F5E8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CARMIL2Q6F5E8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CARMIL2Q6F5E8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CARMIL2Q6F5E8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CARMIL2Q6F5E8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
CARMIL2Q6F5E8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CARMIL2Q6F5E8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CARMIL2Q6F5E8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CARMIL2Q6F5E8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
CARMIL2Q6F5E8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CARMIL2Q6F5E8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC41.38■■■■■ 4.22
CARMIL2Q6F5E8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CARMIL2Q6F5E8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CARMIL2Q6F5E8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CARMIL2Q6F5E8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CARMIL2Q6F5E8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CARMIL2Q6F5E8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CARMIL2Q6F5E8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
CARMIL2Q6F5E8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CARMIL2Q6F5E8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CARMIL2Q6F5E8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
CARMIL2Q6F5E8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CARMIL2Q6F5E8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
CARMIL2Q6F5E8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
CARMIL2Q6F5E8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CARMIL2Q6F5E8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CARMIL2Q6F5E8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
CARMIL2Q6F5E8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
CARMIL2Q6F5E8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CARMIL2Q6F5E8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CARMIL2Q6F5E8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CARMIL2Q6F5E8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CARMIL2Q6F5E8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CARMIL2Q6F5E8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.19
CARMIL2Q6F5E8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms