Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM68Q6AZZ1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM68Q6AZZ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM68Q6AZZ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM68Q6AZZ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM68Q6AZZ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms