Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM200BQ69YZ2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM200BQ69YZ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM200BQ69YZ2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM200BQ69YZ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM200BQ69YZ2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM200BQ69YZ2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM200BQ69YZ2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM200BQ69YZ2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM200BQ69YZ2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM200BQ69YZ2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM200BQ69YZ2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM200BQ69YZ2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM200BQ69YZ2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM200BQ69YZ2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM200BQ69YZ2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM200BQ69YZ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM200BQ69YZ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM200BQ69YZ2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms