Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBRD2Q68DH5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBRD2Q68DH5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBRD2Q68DH5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms