Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
RPRD2Q5VT52 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
RPRD2Q5VT52 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
RPRD2Q5VT52 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
RPRD2Q5VT52 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
RPRD2Q5VT52 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
RPRD2Q5VT52 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
RPRD2Q5VT52 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
RPRD2Q5VT52 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
RPRD2Q5VT52 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
RPRD2Q5VT52 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RPRD2Q5VT52 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RPRD2Q5VT52 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RPRD2Q5VT52 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RPRD2Q5VT52 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
RPRD2Q5VT52 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
RPRD2Q5VT52 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
RPRD2Q5VT52 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RPRD2Q5VT52 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RPRD2Q5VT52 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RPRD2Q5VT52 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RPRD2Q5VT52 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RPRD2Q5VT52 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RPRD2Q5VT52 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RPRD2Q5VT52 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RPRD2Q5VT52 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC38■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RPRD2Q5VT52 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RPRD2Q5VT52 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RPRD2Q5VT52 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RPRD2Q5VT52 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RPRD2Q5VT52 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RPRD2Q5VT52 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RPRD2Q5VT52 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RPRD2Q5VT52 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RPRD2Q5VT52 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RPRD2Q5VT52 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RPRD2Q5VT52 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RPRD2Q5VT52 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RPRD2Q5VT52 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RPRD2Q5VT52 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms