Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC01545Q5VT33 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01545Q5VT33 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01545Q5VT33 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms